以前のエントリ。
2007/10/22 em1keypc 64bit Windows でも 親指シフト
これ以降もプログラムを何度か更新しました。
最新版は下記からどうぞ。

em1keypc 1.31 for PC Win32/Win64
oyayubiwm v1.44

今のところ他の方の 64環境で動いているかわかりませんが、
自分は WindowsVista x64 環境×2 で em1keypc + oyayubiwm を常時
起動しています。(ドッグフードを兼ねて)
64bit といっても特別な操作も設定も必要なく、全く同じバイナリを
起動するだけでよくなっています。